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MacroAPE 1083:CDC5L si

From FANTOM5_SSTAR

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Full Name: CDC5L_si

Motif matrix
POACGT
11.51.56.50.5
20.02.04.04.0
32.00.08.00.0
45.01.01.03.0
50.01.03.06.0
62.00.02.06.0
71.00.00.09.0
89.00.01.00.0
98.00.00.02.0
101.06.00.03.0
116.00.03.01.0
122.01.00.07.0
138.01.01.00.0
146.00.01.03.0
150.752.751.754.75

Sample specificity

The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon


TomTom analysis

<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya


Target_ID

Optimal_offset

p-value

E-value

q-value

Overlap

Query
consensus
Target
consensus

Orientation

CG11617#MA0173.1-50.0005191040.2470930.493547GGGATTTAACATAATTTAACAT+
FOXL1#MA0033.1-50.001907790.908110.7494598GGGATTTAACATAATTATACATA+
caup#MA0217.1-60.003474471.653850.7494595GGGATTTAACATAATTAACA+
NFIL3#MA0025.1-30.003527591.679130.74945911GGGATTTAACATAATATGTTACATAA-
NHP6A#MA0345.100.00394141.87610.74945915GGGATTTAACATAATTCATTTTTATATATAGGTCAT-
NHP6B#MA0346.1-10.00491022.337250.77806414GGGATTTAACATAATTCATATTATATATAAATAAA-
CIN5#MA0284.1-60.006475933.082540.848999GGGATTTAACATAATTTACGTAATC+
YAP6#MA0418.110.007143723.400410.8489915GGGATTTAACATAATGGTCTGATTACGTAAGCGAC+
YAP1#MA0415.100.009388984.469160.99184515GGGATTTAACATAATACGAGCTTACGTAAGCAAAT-
SMP1#MA0383.120.01255645.976850.99869115GGGATTTAACATAATTGCTAATTTAATTATAGGTAA-
Evi1#MA0029.1-20.01372376.532470.99869113GGGATTTAACATAATAAGATAAGATAATA+
mirr#MA0233.1-60.01592637.580940.9986915GGGATTTAACATAATAAACA+
HLF#MA0043.1-40.01745798.309950.99869111GGGATTTAACATAATGGTTACGCAATT+
ara#MA0210.1-60.01866048.882360.9986915GGGATTTAACATAATTAACA+
exd#MA0222.1-30.01988549.465430.9986918GGGATTTAACATAATTTTTGACA+