MacroAPE 1083:GCM1 f1
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: GCM1_f1
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ACE2#MA0267.1 | -4 | 0.000559689 | 0.266412 | 0.268599 | 7 | CACATGCGGGTATT | TGCTGGT | - |
| SWI5#MA0402.1 | -4 | 0.000767072 | 0.365126 | 0.268599 | 8 | CACATGCGGGTATT | TGCTGGTT | + |
| SOK2#MA0385.1 | -1 | 0.000848432 | 0.403853 | 0.268599 | 11 | CACATGCGGGTATT | ACCTGCAGGCA | + |
| YGR067C#MA0425.1 | 2 | 0.00265809 | 1.26525 | 0.504904 | 12 | CACATGCGGGTATT | TGAAAAAGTGGGGT | - |
| YML081W#MA0431.1 | -3 | 0.00427817 | 2.03641 | 0.65723 | 9 | CACATGCGGGTATT | GTGCGGGGT | - |
| PHD1#MA0355.1 | -1 | 0.00484403 | 2.30576 | 0.65723 | 10 | CACATGCGGGTATT | TGCTGCAGGT | - |
| ZMS1#MA0441.1 | -4 | 0.00690769 | 3.28806 | 0.820072 | 9 | CACATGCGGGTATT | TGCGGGGAA | - |
| MIG3#MA0339.1 | -4 | 0.0092299 | 4.39343 | 0.884422 | 7 | CACATGCGGGTATT | TGCGGGG | - |
| RUNX1#MA0002.1 | -1 | 0.00975064 | 4.64131 | 0.884422 | 11 | CACATGCGGGTATT | TATTGTGGTTA | + |
| MIG2#MA0338.1 | -4 | 0.0102434 | 4.87585 | 0.884422 | 7 | CACATGCGGGTATT | TGCGGGG | - |
| Pax6#MA0069.1 | 2 | 0.0139316 | 6.63145 | 0.997635 | 12 | CACATGCGGGTATT | AACTCATGCGTGAA | - |
| Arnt::Ahr#MA0006.1 | -4 | 0.0172564 | 8.21406 | 0.997635 | 6 | CACATGCGGGTATT | TGCGTG | + |
| run::Bgb#MA0242.1 | -3 | 0.0202481 | 9.63811 | 0.997635 | 9 | CACATGCGGGTATT | TTGCGGTTA | - |
