MacroAPE 1083:GLI3 si
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: GLI3_si
| Motif matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Macho-1#MA0118.1 | -1 | 0.000402369 | 0.191528 | 0.383055 | 9 | TTGGGTGGTCC | TGGGGGGTC | + |
| RREB1#MA0073.1 | 5 | 0.00147124 | 0.700311 | 0.700311 | 11 | TTGGGTGGTCC | TGGGGGGGGGTGGTTTGGGG | - |
| opa#MA0456.1 | 2 | 0.00303255 | 1.4435 | 0.733079 | 10 | TTGGGTGGTCC | CAGCGGGGGGTC | - |
| RUNX1#MA0002.2 | 0 | 0.00308016 | 1.46616 | 0.733079 | 11 | TTGGGTGGTCC | GTCTGTGGTTT | + |
| Lag1#MA0193.1 | -1 | 0.00602002 | 2.86553 | 0.895785 | 7 | TTGGGTGGTCC | TTGGTAG | - |
| Klf4#MA0039.2 | -1 | 0.00658666 | 3.13525 | 0.895785 | 10 | TTGGGTGGTCC | TGGGTGGGGC | + |
| z#MA0255.1 | 0 | 0.00658666 | 3.13525 | 0.895785 | 10 | TTGGGTGGTCC | TTGAGTGATT | + |
| Arnt::Ahr#MA0006.1 | -1 | 0.00957642 | 4.55838 | 1 | 6 | TTGGGTGGTCC | TGCGTG | + |
| SWI5#MA0402.1 | -2 | 0.0099017 | 4.71321 | 1 | 8 | TTGGGTGGTCC | TGCTGGTT | + |
| RAP1#MA0359.1 | 3 | 0.0131961 | 6.28132 | 1 | 7 | TTGGGTGGTCC | TGTATGGGTG | - |
| znf143#MA0088.1 | 10 | 0.0143407 | 6.82615 | 1 | 10 | TTGGGTGGTCC | GCAAGGCATGATGGGAAATC | - |
| Egr1#MA0162.1 | -1 | 0.0152019 | 7.23609 | 1 | 10 | TTGGGTGGTCC | TGCGTGGGCGT | + |
| ACE2#MA0267.1 | -2 | 0.0203084 | 9.6668 | 1 | 7 | TTGGGTGGTCC | TGCTGGT | - |
